Akademická obec vysoké školy
Akademičtí pracovníci a studenti VŠ tvoří akademickou obec vysoké školy. Akademickými pracovníky jsou zaměstnanci VŠ vykonávající jak pedagogickou, tak vědeckou, výzkumnou, vývojovou, uměleckou nebo další tvůrčí činnost. Na výuce se mohou podílet i další odborníci a hostující profesoři. Studentem se uchazeč stává dnem zápisu do studia, přestává jím být dnem ukončení studia nebo přerušení studia. Student má práva a povinnosti vymezené ustanoveními zákona, mezi něž patří např. právo studovat, právo výběru studijních předmětů, právo výběru učitele či právo volit a být volen do akademického senátu. Student je zároveň povinen dodržovat vnitřní předpisy VŠ a jejích součástí. Zaviněné porušení povinností je disciplinárním přestupkem.
Státní správa vysokého školství
Ústředním orgánem státní správy pro VŠ je Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy. Jeho působnost na tomto úseku vymezuje zákon o VŠ, když mu mj. přiznává kompetenci registrovat vnitřní předpisy veřejných VŠ, rozdělovat finanční prostředky ze státního rozpočtu z kapitoly školství a kontrolovat jejich využití či rozhodovat o udělení akreditace a státního souhlasu. Významnou pravomoc ministerstva představuje rozhodování o udělení akreditace jednotlivým studijním programům (na základě stanoviska Akreditační komise, jejímž úkolem je pečovat o kvalitu vysokoškolského vzdělávání a všestranně posuzovat vzdělávací a vědeckou, výzkumnou, vývojovou, uměleckou nebo další tvůrčí činnost vysokých škol), stejně tak podléhá ministerské akreditaci i oprávnění konat habilitační řízení nebo řízení ke jmenování profesorem v daném oboru. Ministerstvo vykonává též státní dozor nad veškerými VŠ a v rámci tohoto dozoru je oprávněno vyzvat VŠ k nápravě v přiměřené lhůtě, omezit výkon působnosti orgánů veřejné VŠ nebo její součásti, popřípadě může veřejné VŠ nebo její součásti výkon této působnosti odejmout, resp. odejmout soukromé VŠ udělený státní souhlas. Ministerstvo rovněž rozhoduje o uznání zahraničního vysokoškolského vzdělání a kvalifikace, pokud je ČR vázána mezinárodní smlouvou se zemí, kde je zahraniční VŠ zřízena a uznána, a ministerstvo je touto smlouvou k uznání zmocněno (v ostatních případech rozhoduje rektor veřejné VŠ, která uskutečňuje obsahově obdobný studijní program).